Dopo aver sconfitto FunFrock alla fine di Little Big Adventure, Twinsun era tranquillo, fino a quando una tempesta improvvisa coprì Cittadella Island. Il Dino-Fly, una creatura incontrato in LBA viene colpito da un fulmine e si schianta nel giardino di Twinsen e Zoe. Twinsen cerca l'aiuto di Ker'aooc, un mago di guarigione, che vive a Desert Island, ma i traghetti vengono cancellati. Egli aiuta Bersimon che guida il clima dell'isola e di conseguenza le nuvole scompaiono. Dopo la tempesta, creature aliene, che si definiscono Esmers, atterrano sul pianeta sotto un pretesto diplomatico falso e Twinsen inizia la sua formazione nella scuola del Mago dopo aver sentito che dei bambini erano scomparsi dal pianeta.